不管是什么病都是有病因，宝宝早晚咳嗽也是因为多种不同的原因造成的，其中最为常见的原因就是病原微生物感染，其次就是气管异物导致宝宝咳嗽。宝宝咳嗽分为急性咳嗽和慢性咳嗽两种，不同的咳嗽，症状不同，原因不同，具体的治疗方法也不同。
病原微生物感染(40%)：
许多病原微生物，如百日咳杆菌、结核杆菌等细菌及病毒、肺炎支原体、衣原体等引起的呼吸道感染，是儿童慢性咳嗽最常见的原因，多见于5岁以下的儿童。如果治疗不及时，细菌或病毒向下蔓延就会产生肺炎。咳嗽不断加重，并出现不同程度的发热，体质较差或病情较重的儿童有可能出现休克或死亡。这类咳嗽呈刺激性干咳，或伴少量白色黏痰，同时可能会有声音嘶哑等，治疗以抗感染为主。
气管异物(20%)：
气管异物是1-3岁儿童慢性咳嗽主要原因。这类咳嗽通常表现为阵发性剧烈呛咳，同时会有单侧呼吸音减低、喘息、窒息史等表现，也可仅表现为慢性咳嗽伴阻塞性肺气肿或肺不张。睡觉时可用枕头把宝宝的后背和头撑起，防止分泌出的黏液滴落喉咙造成窒息。
急性和慢性咳嗽的病因
一般将宝宝的咳嗽分为急性咳嗽和慢性咳嗽两大类，急性咳嗽主要和呼吸道的感染有关。一些病毒或细菌会引发上呼吸道感染，出现感冒、鼻窦炎、支气管炎、甚至肺炎。通常在感染症状消除之后，咳嗽的情形也会跟着消失。例如呼吸道融合病毒最常造成一岁以下宝宝急性呼吸道感染的主因，尤其容易引发急性细支气管炎，症状除了咳嗽、流鼻水、呼吸变浅快之外，有时还会出现咻咻的喘鸣声，严重时还有可能出现呼吸窘迫，甚至发绀的情形。
至于慢性咳嗽，引发的原因就比急性咳嗽要来得多且复杂，例如因过敏所引发的咳嗽，一般在夜间睡眠时咳嗽会加剧，有些会出现哮鸣声或喘的现象。一般过敏性肺炎所引发的咳嗽，常常和外在环境刺激有关，医学上又称之为过敏原。